Формирование фондов — это самый ответственный вид деятельности музея, в результате фонды пополняются как материальными, так и нематериальными объектами исторического наследия, оказывающие влияние на научно-исследовательскую, экспозиционную и просветительскую деятельность музея.
Формирование фондов началось в 2010 году, в настоящее время основной фонд музея-заповедника «Трехречье» — это фотографии, документы людей, переживших сталинские репрессии в СССР, а также личные вещи и инструменты, которыми работали сосланные и заключенные в лагерях Таштагольского района, их было более 30-ти. Одним из таких лагерей являлся лагерь, расположенный в п. Кантус, где руками заключенных были проложены рельсы узкоколейки, по которым ходили мотовозы груженные лесом и вагончики, перевозившие заключенных к месту работы.
Корпус кабины мотовоза и рельсы узкоколейки, привезенные из лагерного отделения поселка Кантус, занимают свое место в интерактивной зоне экспозиции «Промзона».
Фонды музея-заповедника Трехречье пополнились уникальными предметами, имеющие не только историческое значение, но и большую редкость. Это бадья золотоискателей, деревянная конусообразная деталь от старательских приспособлений и железная лопатка, использовались рабочими при добыче золота.
Бадья сделана кустарно из железа и дополнительно окована полосами железа для прочности, чтобы не выдавило днище и стенки. Такими емкостями старатели вытаскивали из шурфов породу в поисках рассыпного золота. Помещалось в неё около 40 кг породы. Находящийся в шурфе старатель нагребал породу со дня шурфа, рабочие, находящиеся наверху воротом поднимали ее. Потом породу отвозили к месту промывки на тачке.
Подобные бадьи применялись в старательстве в 30 годы ХХ века.
Эти предметы пролежали в земле почти сто лет, при проведении розыскных работ геологами, данные предметы были извлечены на свет и теперь посетители воочию могут увидеть настоящую бадью старателей в нашем музее.